Die Fachschaft Bioinformatik vergibt drei Lehrpreise: die Dozierendenlehrpreise an TU und LMU, und den Tutorlehrpreis. Die Lehrpreise für Dozierende an TUM und LMU können an alle Dozierenden der jeweiligen Universität vergeben werden, die eine Lehrveranstaltung halten, die im Modulkatalog des Bachelor- oder Masterstudiengangs Bioinformatik enthalten ist. Der Lehrpreis für Tutoren kann nur an Tutoren einer Lehrveranstaltung, die mehrheitlich von Bioinformatikern belegt wird vergeben werden.

Alle Lehrpreise werden zusammen auf der Absolventenfeier vergeben. Vor der Vergabe gibt es eine zweiwöchige Nominierungsperiode, in der ihr Dozierende bzw. Tutoren per E-Mail an die offizielle Fachschaftsadresse mit Betreff »Nominierung Lehrpreis [Tutor|LMU|TUM]« nominieren könnt. Schreibt dazu den Namen, die E-Mail-Adresse und bei Tutoren die tutorierte Lehrveranstaltung in den Körper der E-Mail. Dozierende oder Tutoren, die innerhalb der letzten drei Jahren einen der Lehrpreise gewonnen haben, können nicht nominiert werden.

Danach gibt es eine ebenfalls zweiwöchige Wahlperiode, in der online für die jeweiligen Nominanten abgestimmt werden kann. Die Wahl erfolgt anonym und geheim. Die Ergebnisse werden – abgesehen von den Preisträger:innen – nicht bekanntgegeben. Die Links für die Wahl werden von der Fachschaft per E-Mail und über die Info-Gruppe bekanntgeben. Jede:r Studi kann dabei für alle Preise abstimmen, und insbesondere auch mehrere Lehrveranstaltungen oder Tutorien eines Nominanten berücksichtigen.